De tweede opdracht die Herakles krijgt is ook zwaar. De held moet de Hydra van Lerna, een negenkoppige giftige waterslang, doden. Als Herakles met een knots een van de koppen van het gevaarlijke dier vermorzelt, komen ervoor in de plaats steeds twee nieuwe koppen. De held weet het dier uiteindelijk toch te verslaan door steeds als hij een kop vermorzelt de hals dicht te schroeien met brandende toortsen. Hierdoor kan er geen nieuwe kop ontstaan.